Организация геномного надзора за респираторными вирусными инфекциями, циркулирующими на территории города Москвы (400,00 руб.)

Первый автор	Латыпова
Авторы	Комаров А.Г., Мигяев О.К., Шпакова О.Г., Веневцев Е.О.
Страниц	7

ID	910547
Аннотация	РЕЗЮМЕ Введение. Вспышки острых респираторных вирусных инфекций ( ОРВИ) экономически воздействуют на систему здравоохранения и представляют угрозу общественному благополучию. Контроль заболеваемости ОРВИ в условиях мегаполиса, особенно в период пандемии COVID- 19, остро нуждался в адекватном инструменте для выявления мутаций и вариантов, уклоняющихся от вакцинального иммунитета и инициирующих подъём заболеваемости. Для своевременного реагирования требовался геномный надзор. Цель исследования — организация Московского геномного центра для геномного надзора за ОРВИ и COVID- 19 с оценкой результатов в период сезонных вспышек на территории столицы. Материалы и методы. При поддержке Департамента здравоохранения города Москвы разработаны и реализованы управленческие и логистические мероприятия, Программа высокопроизводительного секвенирования ( NGS) в образцах пациентов в плановом режиме и в период подъёма заболеваемости ОРВИ и COVID- 19, технические процедуры выполнения NGS, обеспечена безопасность обмена данными и биобезопасность медицинского персонала. Результаты. В структуре Департамента здравоохранения города Москвы создан Московский геномный центр. За период с октября 2023 г. по апрель 2024 г. данные таргетного NGS ( панель на 32 патогена, исследовано 6528 образцов) : SARS- CоV- 2 доминировал весь период, заболеваемость гриппом А ( H3N2) резко возросла с начала декабря и резко снизилась к концу января. Сменяемость генетических линий SARS- CoV- 2: доминировала линия XBB ( наиболее представлены: XBB. 1. 16, XBB. 1. 16. 11) с октября по конец января, затем преобладала линия JN ( наиболее представлена: JN. 1, также встречаются JN. 1. 13, JN. 1. 18, JN. 1. 19, JN. 1. 4) . Сменяемость штаммов гриппа А: доминировали H3N2 ( A/ Massachusetts/ 01/ 2020) и H3N2 ( A/ Massachusetts/ 38/ 2019) с декабря по февраль. Ограничения исследования. Для NGS использовали таргетную панель на 32 респираторных вируса, наиболее часто встречающихся в московской популяции. Неполное покрытие всего вириома — условное ограничение. Заключение. В столице организован репрезентативный, качественный и непрерывный генетический надзор. Московский геномный центр успешно реализовал Программу NGS- тестирования и поддержку Российского геномного ресурса микроорганизмов VGARus.

Организация геномного надзора за респираторными вирусными инфекциями, циркулирующими на территории города Москвы / М.Ф. Латыпова [и др.] // Здравоохранение Российской Федерации .— 2024 .— №5 .— С. 412-418 .— URL: https://rucont.ru/efd/910547 (дата обращения: 12.06.2025)